Журнал «Экономические системы» основан в 2008 году.
Зарегистрирован Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор) (свидетельство о регистрации ПИ № ФС 77-48713 от 28 февраля 2012 года).
Согласно Рекомендациям Президиума ВАК, Распоряжением Минобрнауки России от 2 декабря 2019 г. № 524-р научный журнал «Экономические системы» включен в перечень рецензируемых научных изданий.
В соответствии с Рекомендациями Президиума ВАК от 21 декабря 2023 г. № 3-пл/1 научному журналу «Экономические системы» присвоена категория К2.